太祖洪武二年（己酉，一三六九）夏四月，时倭寇出没海岛中，数侵掠苏州、崇明，杀略居民，劫夺货财，沿海之地皆患之。太仓卫指挥佥事翁德帅官军出海捕之，遇於海门之上帮，及其未阵，麾兵冲击之，斩获不可胜计，生擒数百人，得其兵器海艘。命擢德指挥副使，其官校赏绮币白金有差，仍命德领兵往捕未尽诸寇。
三年（庚戌，一三七〇）三月，遣莱州同知赵秩，持诏谕日本国王良怀，令革心归化。日本，古倭奴国，在东海中，绾波而宅。自玄菟、乐浪底於徐闻、东筦，所通中国处，无虑万余里。国君居山城，所统五畿、七道、三岛，为郡五百七十有三。然皆依水附屿，大者不过中国一村落而已。户可七万，课丁八十八万三千有奇。自元帅讨日本者没於水，不得志，日本亦不复来贡。至是，帝遣使谕降之。
四年（辛亥，一三七一）冬十月癸巳，日本国王良怀遣其僧祖朝来进表笺，贡马方物，并僧九人来朝，又送至明州、台州被掠男子七十余人，诏赐文绮答之。
十二月，诏靖海侯吴桢籍方国珍所部温、台、庆元三府军士，及兰秀山无田粮之民尝充船户者，凡十一万一千七百余人，隶各卫为军。仍禁滨海民不得私出海，时国珍余党多入海剽掠故也。祯既至，三郡每挟私意，多引平民为兵，濒海大扰。宁海知县王士弘曰：“吾宁获死罪，不可诬良民为兵。”即上封事，词甚切，上立罢之。
六年（癸丑，一三七二）春正月，德庆侯廖永忠上言：“今北边遗孽，远遁万里之外，独东南倭寇负禽兽之性，时出剽掠，扰濒海之民。陛下命造海舟，剪捕此寇，以奠生民，德至盛也。然臣窃观倭彝窜伏海岛，因风之便，以肆侵略，来若奔狼，去若惊鸟。臣请令广洋、江阴、横海水军四卫添造多橹快船，令将领之。无事则沿海巡徼，以备不虞。倭来则大船薄之，快船逐之。彼欲为内寇，不可得也。”上从之。
七年（甲寅，一三七四）夏六月，倭寇胶海，靖海侯吴祯率沿海各卫兵，捕至琉球大洋，获倭寇人船，俘送京师。
十三年（庚申，一三八〇）春正月，胡惟庸谋叛，约日本，令伏兵贡艘中。会事觉，悉诛其卒，而发僧使於陕西、四川各寺中，示後世不与通。
十七年（甲子，一三八四）春正月，倭频寇浙东，命信国公汤和巡视海上。筑山东，江南、北，浙东、西海上五十九城，咸置行都司，以备倭为名。
二十年（丁卯，一三八七）二月，置两浙防倭卫、所。夏四月戊子，命江夏侯周德兴往福建福、兴、漳、泉四郡视要害，筑海上十六城，籍民为兵，以防倭寇。增置巡检司四十有五，分隶诸卫。
二十二年（己巳，一三八九）冬十二月，倭寇宁海，寻犯广东。
二十七年（甲戌，一三九四）春二月，倭寇浙东，命都督杨文、刘德、商暠巡视两浙。复命魏国公徐辉祖、安陆侯吴杰往浙，训练海上军士，同杨文等防倭。
秋八月，命吴杰同永定侯张全往广东，训练海上军士防倭。
冬十月，倭寇金州。
三十一年（戊寅，一三九八）春二月，倭寇山东、浙东。
成祖永乐元年（癸未，一四〇三），日本王源道义遣使入贡，赐冠服文绮，给金印。
四年（丙戌，一四〇六）冬十月，平江伯陈瑄督海运至辽东。舟还，值倭於沙门，追击至朝鲜境上，焚其舟，杀溺死者甚众。
九年（辛卯，一四一一）春正月丙戌，命丰城侯李彬、平江伯陈瑄等率浙江、福建舟师剿捕海寇。三月，中军都督刘江守辽东，不谨斥堠，海寇入寨，杀边军。上怒，遣人斩江首；既而宥之，使图後效。
夏五月，倭寇浙东。
十四年（丙申，一四一六）夏五月，敕辽东总兵、都督刘江及缘海卫、所备倭寇，相机剿捕。命都督同知蔡福等率兵万人，於山东沿海巡捕倭寇。
六月，倭舟三十二艘泊靖海卫杨村岛，命福等合山东都司兵击之。
十二月，置辽东金州旅顺口望海埚、左眼、右眼、三手山、西沙洲、山头、爪牙山敌台七所。
十五年（丁酉，一四一七）春正月，倭寇浙江松门、金乡、平阳。冬十月，遣礼部员外郎吕渊等使日本。先是，帝命太监郑和等齎赏谕诸海国，日本首先归附，诏厚赉之。封其镇山，赐勘合百道，与之期，期十年一贡。无何，捕倭将士寇数十俘献京师，俱日本人，群臣请诛之，以正其罪。上乃遣渊赐敕切责之。
十七年（己亥，一四一九）夏六月，辽东总兵、都督刘江大破倭寇於望海埚。先是，江巡视各岛，至金州卫金线岛西北望海埚上。其地特高广，可驻兵千余。询诸土人，云：“洪武初，都督耿忠亦尝於此筑堡备倭，离金州城七十余里。凡寇至，必先经此，实滨海咽喉之地。”上疏请“用石垒堡，置烟炖了望”。上从之。一日，了者言：“东南夜举火有光。”江计寇将至，亟遣马、步官军赴埚上堡备之。翼日，倭寇二千余乘海埚直逼埚下，登岸鱼贯行。一贼貌丑恶，挥兵率众，势锐甚。江令犒师秣马，略不为意。以都指挥徐刚伏兵於山下，百户江隆帅壮士潜烧贼船，截其归路。乃与之约曰：“旗举伏起，鸣炮奋击，不用命者，以军法从事。”既而贼至埚下，江披发举旗鸣炮，伏尽起。继以两翼并进。贼众大败，死者横仆草莽，余众奔樱桃园空堡。官军追围之，将士奋勇，请入堡剿杀。江不许，特开西壁以待其奔，分两翼夹击之。生擒数百，斩首千余。间有脱走（舟酋）者，又为隆等所缚，无一人逸者。凯还，将士请曰：“将军见敌，意思安闲，惟饱士马。及临阵，作真武披发状。迨贼入堡，不杀而纵之，何也？”江曰：“穷寇远来，必劳且饥。我以逸饱待饥劳，固治敌之道。贼始鱼贯而来为蛇阵，故披发作此状以镇服之。所以愚士卒之耳目，作士卒之锐气。贼既入堡，有死而已。我师攻之，彼必致死，未必无伤。寇出，纵其生路，即‘围师必缺’之意。此固兵法，顾诸君未察耳。”事闻，上赐敕褒进，封江广宁伯，子孙世袭，将士赏赉有差。先是，元末濒海盗起，张士诚、方国珍余党导倭寇出没海上，焚民居，掠货财，北自辽海、山东，南抵闽、浙、东粤，滨海之区，无岁不被其害。至是，为江所挫，敛迹不敢大为寇。然沿海稍稍侵盗，亦不能竟绝。
英宗正统四年（己未，一四三九）夏四月，倭寇浙东。先是，倭得我勘合，方物戎器满载而东。遇官兵，矫云入贡。我无备，即肆杀掠，贡即不如期。守臣幸无事，辄请俯顺倭情。已而备御渐疏。至是，倭大暠入桃渚，官庾民舍焚劫，驱掠少壮，发掘塚墓。束婴孩竿上，沃以沸汤，视其啼号，拍手笑乐。得孕妇卜度男女，刳视中否为胜负饮酒，积骸如陵。於是朝廷下诏备倭，命重师守要地，增城堡，谨斥堠，合兵分番屯海上，寇盗稍息。
世宗嘉靖二年（癸未，一五二三）五月，日本诸道争贡，大掠宁波沿海诸郡邑。鄞人宋素卿者，初奔日本。正德六年，与其国人源永寿来贡。其从父澄识之，告素卿附倭状。守臣以闻，置不问。至是，其主源义植幼闇不能制命，群臣争贡，各强给符验。左京兆大夫内艺兴遣僧宗设，右京兆大夫高贡遣僧瑞佐及宋素卿先後至宁波，争长不相下。故事：番货至，市舶司阅货及宴坐，并以先後为序。时瑞佐後，而素卿狡，贿市舶太监。先阅佐货，宴又坐设上。宗设不平，遂与佐相雠杀。太监又以素卿故，阴助佐，授之兵器。而设众强，拒杀不已，遂毁嘉宾堂，劫东库，逐瑞佐及余姚江，佐奔绍兴。设追之城下，令缚佐出，不许，乃去。沿途杀掠至西霍山洋，杀备倭都指挥刘锦、千户张镗。执指挥袁璡、百户刘恩。又自育王岭奔至小山浦，杀百户胡源，浙中大震。设负固据海岙，巡按御史欧珠、镇守太监梁瑶奏闻，逮素卿下狱待讯。倭自是有轻中国心矣。给事中夏言上言：“倭患起於市舶。”遂罢之。初，太祖时虽绝日本，而二市舶司不废。市舶故设太仓黄渡。寻以近京师，改设福建、浙江、广东。七年罢，未几复设。盖以迁有无之货，省戌守之费，禁海贾，抑奸商，使利权在上也。自市舶内臣出，稍稍苦之。然所当罢者市舶内臣，非市舶也。至是，因言奏，悉罢之。市舶罢，而利权在下。奸豪外交内詗，海上无宁日矣。“)