自此之后，山门越来越衰落，除十二禅众之外，很少有住在那里的僧侣了。各处山谷里僧院的讲演也多已停止了，本殿里的功课也停顿下来。修学之窗既闭，坐禅之床亦空；四教五时，春花不复发香，三谛即是，秋月亦复昏暗。三百余年之法灯，无复人挑；六时不断之香烟，也将中断。当年堂舍高耸，三重楼台插于碧空之中；栋梁竞秀，四面椽头隐于白雾之间。而今天只有山风雨露供奉佛前；月夜的灯光，从破败的檐间透出；惟有早晨的露珠成了莲座上的装饰。
到了末世，三国的佛法也都先后衰微了。在遥远的天竺，昔日释迦弘法的竹林精舍，给孤独园，此时已成狐狼栖息之地，只有残壁断垣隐约可见了。竹林园中，白鹭池水早已干涸，只有野草丛生；退凡下乘的碣石也早已颓圮，布满青苔了。震旦的天台山、五台山、白马寺、玉泉寺等地，都已荒废再无僧人居住，大乘、小乘的经文都在箱中朽成了灰，我国南都的七大寺也已荒废，八宗九宗都已绝迹。爱宕、高雄等地，昔日堂塔林立，而今，一夜之间全变成了废墟，成为天狗栖息之所了。倍受尊崇的天台宗圣地，想不到在当今治承之世竟会颓圮，凡是有人心的无不为之悲叹。在已无僧人居住的居室的柱子上，有人题了一首歌：
忆当年，崇佛护国称灵地；
看如今，僧房空寂成荒山。
这也许是因为想起了当初传教大师在这里草创时，曾祈祷无上正等觉诸佛加以护佑的事，才题下这首歌的吧，实在令人不胜感慨！每月八日是药师如来的缘日，却听不到诵念“南无药师”的声音；四月是山王权现垂迹的月份，也没有奉献币帛的人们；只有那朱色的玉垣显得神圣古旧，残留着一些标绳叫人凭吊而已。
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在比睿山的法华三昧堂里修行三昧的十二个僧人。
释迦一生的说教，分为四种，称之为四教。天台宗分别称之为顿、渐、秘密、不定；按时期又可分为五时，即华严时、鹿苑时、方等时、般若时、法华涅槃时。
三谛即是乃是天台宗的教义，意为三谛即是实相，犹云空谛、假谛、中谛这三个真理原是一体。
指一昼夜之间的早晨、日中、日没、初夜、中夜、后夜。
即印度、中国、日本。
即释迦修行之处。亦即第一卷第一节中的祇园。
原文为卒都婆，系梵语的音译，原意是塔，后来凡在墓后竖立木石，上作塔形，以为纪念者，也有此称。这里的卒都婆似用作指示牌，故译为碣石。退凡是说凡人到此告退；下乘是说王者至此下车。据说是释迦在灵鹫山说法时，摩迦陀国王前来听讲，乃于路旁建此碣石两座，一曰退凡，一曰下乘。
佛教的俱舍宗、成实宗、律宗、法相宗、三论宗、天台宗、华严宗、真言宗，谓之八宗；外加禅宗，共为九宗。
是日本传说中的怪物，人形，有翅，赤面，高鼻，神通广大。
参见第二卷第一节注四、注十一。
即具有领悟一切真理的至高无上的智慧。
比睿山根本中堂所祀药师如来，每月八日是他的缘日，即神佛降世示其有缘的日子，照例举行礼拜仪式。
山王是药师如来在日本垂迹的化身大物主神。
玉垣是对神社的墙垣的尊称。
标绳亦作注连绳，取“章断注连”的意思。是一种稻草绳，特别从左搓成，中间垂下三根、五根、七根稻草，所以又称三五七绳，悬挂门口，标示内外界限，绳内是净地，把一切邪恶疾疫阻隔在外面。