当即，左宗棠给赖云亭写了信，嘱其采购机器、挑选人才、由汉口取道来兰州。同时，给陕西巡抚刘典写信，叫他购买硝磺，提炼火药。
虞绍南具体操办制造局，在兰州南关选好了厂址，并且请人设计好图后，厂房已在建造之中。
这期间，左宗棠又给朝廷拟了一个奏折，陈述关外无劲军健将，又事权不一，为时太久，必启戒心。
左宗棠在奏折中，坦言声明：景廉“泥古太过，无应变之才。所倚之人，阿谀倚势，少所巨助”。并言明，恐误国事，朝廷需视情将景廉督办军务移为他人，如朝廷信任，他左宗棠愿请缨担此重任，率部迅速出关，征讨匪帮，规复大清疆域。
在拟奏折上款时，左宗棠本想将太后放在皇上后面。自同治帝亲政后，朝廷已有明谕，所有奏请，以皇上第一，太后次之，但许多官员仍以太后第一，为的是怕得罪太后。而左宗棠却以明谕为准，把皇上放在第一。这次，左宗棠为这个排列，动了脑筋，最后还是将太后放在了第一。
原因之一，是前几天收到一道同治的明谕，上面写道：
朕于本月遇有天花之喜，经惇亲王等合词呈恳，静心调摄，朕思万机至重，何敢稍耽安逸，惟朕躬见在尚难耐劳，自应俯从所请，但恐诸事无所秉承，深虞旷误，再三吁恳两官皇太后，俯念朕躬，正资调养，所有内外各衙门陈奏事件，呈请披览裁定，仰荷慈怀由体俯允，权宜办理，朕心实深感幸，将此通谕中外知之。
就是说，太后威逼皇上，借皇上生病之际，又凌驾于皇上之上了。
原因之二，太后剪除左宗棠财路和船局，静观左宗棠动态，此时如将太后列入皇上之后，刚好被太后抓个正着，知左宗棠恨她，恐怕西征大任，难降左宗棠肩上。慈禧特别注重大臣对她的态度。
以左宗棠的脾气，是绝不会被太后淫威就范的。但为西征大事，在宗棠忍了。
左宗棠将太后列第一，皇上次之，拜发了奏折。他还不知道同治对他抬棺入肃州的事大为光火呢。
此时的同治，已病入膏肓，仍按出天花诊治，他有苦难言，便胡来了，一日连下数道上谕：
第一道是崇上两宫太后徽号。
第一道以下用“奉懿旨”的名义，封慧妃为皇贵妃，瑜嫔等晋位为皇妃。
第三道加恩内廷行走人员，自惇王以下，或赏食双俸，或赏食进一级俸。连醇王之子载湉，只有四岁，也赏头品顶戴，赏食辅国公俸禄了。
此外，军机大臣、内务府大臣、弘德殿行走的师傅、南书房、上书房翰林等，或赏双眼花翎，或加官衔，或优先补缺。京内外文武大小官员均加封两级。京师各营兵丁，赏粮钱半个月。
第四道上谕则为减刑恤狱。
凡此皆为两官太后“做好事，以期化戾气为祥和，上讶天麻”。
那天的大臣们接旨，腿都跪麻了，不断有圣旨到，全是好事，大臣们都面无喜色，对这一道道上谕持怀疑态度。“)